Lorsque vous traitez avec des pétaoctets de données scientifiques, tout mettre dans le nuage peut prendre du temps. Mais une fois que c’est là-bas, il est simple de faire des expériences sur vos données depuis n’importe où dans le monde – et tout ce dont vous avez besoin pour télécharger ce sont vos résultats. Convaincre les chercheurs d’adhérer à ce changement de paradigme peut toutefois compter sur l’appui de partenaires de l’organisation et au-delà, a appris Keith Perry, vice-président directeur et directeur de l’information de l’hôpital de recherche pour enfants St. Jude de Memphis, au Tennessee.
St . Jude travaille à la cartographie de la génétique des cancers chez l'enfant dans le cadre de sa recherche de remèdes. Il utilise le séquençage génétique pour déterminer l’ensemble des séquences du génome – essentiellement l’ADN – des cellules saines de ses patients ainsi que de leurs tumeurs. La comparaison des deux, ainsi que des génomes d’autres patients atteints de cancers similaires, peut fournir des indices essentiels pour un traitement curatif.
C’est un gros problème de données. St. Jude a enregistré la totalité des séquences du génome de plus de 5 000 patients, chaque séquence représentant environ 100 gigaoctets. Les chercheurs sont peut-être à la recherche de mutations ou d’autres marqueurs génétiques dans quelques octets de ce fait.
En raison de la rareté de certains de ces cancers chez l’enfant, les chercheurs du monde entier souhaitent comparer les données – mais ce n’est pas facile compte tenu des volumes impliqués. Perry cite l'exemple d'un chercheur qui a mis six mois à télécharger un grand ensemble de données et à en vérifier la qualité, puis à quelques jours à peine pour exécuter l'analyse.